Baseado na ocorrência: 

Endémicas – prevalecem numa região (não se expande). Constantemente presente de ano para ano e pode ser moderada a severa.

Epidémicas – ocorrem periodicamente e ocupam vastas áreas.

Esporádicas – ocorrem em intervalos e locais irregulares

Pandémicas – ocorrem em todo mundo com resultados catastróficos.

Baseado nos órgãos atacados 

Ex: doenças das raízes, doenças foliares, etc.

Baseado no tipo de plantas afectadas 

Ex: doenças de plantas florestais, doenças de citrinos etc

Baseado no agente causador 

Doença infecciosa ou biótica – causadas por agentes que possuem a capacidade de se multiplicar (fungos, bactérias) ou ser replicados pela planta hospedeira (vírus), gerando desta forma mais inoculo para novas infecções.

Doenças não infecciosas ou abióticas – causadas por factores do meio no qual se encontra a planta. Factores ambientais (temperatura, luz, nutrientes, pH etc) e agentes químicos (poluição atmosférica, herbicidas, insecticidas etc).

Características gerais destas doenças: 

 Causadas por falta ou excesso de algo necessário para a vida das plantas (temperatura, humidade luz etc):

•  Não são transmitidas para plantas sadias;
•  Afectam plantas em qualquer estágio;
•  Os sintomas são bastantes variáveis